Está ubicada junto a la frontera con la República Oriental del Uruguay, frente a la ciudad de Paysandú, por la cual está unida mediante el puente General Artigas. Dista 295 km de Paraná, la capital provincial, y 320 km de la ciudad de Buenos Aires, desde la cual se accede vía Zárate, por el puente Zárate-Brazo Largo, luego por la autopista de la RN 12 hasta empalmar con la RN 14 a la altura de Ceibas, luego, por esta ruta se va hasta el "km 163", donde se toma la RN 135 a la derecha, son 10 km. Desde Córdoba (500 km) y de Santa Fe (350 km) se ingresa a la provincia de Entre Ríos por el túnel subfluvial hasta Paraná, luego por RN 18 hasta Villaguay, y por RP 130 hasta Villa Elisa.

De Rosario por el puente Rosario-Victoria, por Nogoyá (RN 26), y luego por la RP 39 pasando Rosario del Tala y Basavilbaso hasta la RN 14 a la altura de Concepción del Uruguay son 320 km hasta Villa Elisa, con 80 km en mal estado. Se puede modificar yendo por la RN 11 hasta Gualeguay, luego la RP 16 hasta la RN 14 a Gualeguaychú (es mejor carretera pero son 370 km).